一方、総合3番手にポジションを上げた17号車BRエンジニアリングBR1・AERとドラゴンレーシングの10号車BRエンジニアリングBR1・ギブソンは、32周目のグリーン振動後もステイアウトを選択した。そんななか、33周目にフォード・チップ・ガナッシ・チームUKの67号車フォードGTが1コーナーでスピンを喫しグラベルにスタック。これによって3度目のSCランが導入されると、まだピットに入っていなかったプライベーターの2台もピットに戻り、ちょうどレース折返しとなる3時間の時点では1号車レベリオンが実質トップに浮上している。
スタートから3時間7分、3度目のレース再開を迎えると、総合2番手となった8号車トヨタのアロンソがAWDの強みを生かして1号車セナを攻略し、再度総合首位に立つ。一方、抜かれたセナはペースが上がらず。3番手から迫ってきたジェンソン・バトン駆る11号車BRエンジニアリングBR1・AERにも交わされ総合3番手にドロップした。
ピットイン時に後退した7号車トヨタは、22秒先の首位を行く僚友を追うなかで、42周目に1号車レベリオンをパスして表彰台圏内に復帰。47周目にはバトン駆る11号車BR1を捉え、ふたたびトヨタのワン・ツーとなった。
その後、レースは3時間38分過ぎにホームストレート上で炎を上げてストップしたバイコレス・レーシング・チームの4号車ENSO CLM P1／01・ニスモを撤去させるためSCカーが導入されることに。これで約22秒あった8号車と7号車トヨタのギャップが一気に縮まる。
2台のトヨタはSCラン中に7号車、8号車の順でピット作業を追えると、可夢偉がドライブする7号車がアロンソの8号車を先行。その差は、フィニッシュまで2時間を切ったところで迎えたリスタート時点の16秒から、30分後には31秒に広がり7号車トヨタが優位に立った。
この頃になると雨量が減り路面コンディションが回復したことで、各チームは最終スティントのタイヤ選択に頭を悩ませることに。そのなかでワン・ツーを占めるトヨタは、残り1時間あまりとなった82周目に7号車と8号車を呼び戻し、レインタイヤのままコンウェイと一貴をコースに送り出す。
チェッカーまで残り40分、ふたたび雨が強まるとトップ2台の差は20秒を切り、10分後には一貴駆る8号車トヨタが7号車トヨタの後方7秒の位置に迫った。このタイミングでコンウェイの7号車が最後のピットに入り、翌周には一貴もピットへ。しかしピットアウト後、2台のギャップは22秒に広がっている。
残り21分、最終コーナーの手前で17号車BR1が大クラッシュを喫し、このレース5度目のセーフティカーが出動する。これで7号車8号車トヨタのギャップが三度消滅。レースは残り6分で再開され、7号車のコンウェイと8号車を駆る一貴の一騎打ちに。しかし、最後は僅差のままコンウェイの7号車トヨタがトップチェッカーを受け、8号車トヨタは総合2位でフィニッシュ。同3位はバトン組11号車BR1が入った。
LMP2クラスはジャッキー・チェン・DCレーシングの38号車オレカ07・ギブソン（ホー-ピン・タン／ガブリエル・オブリ／ステファン・リケルミ組）が母国でポール・トゥ・ウインを達成。LM-GTEプロクラスでは、アストンマーチン・レーシングの95号車アストンマーチン・バンテージAMR（ニッキー・ティーム／マルコ・ソーレンセン組）が、迫りくる2台のポルシェ911 RSR勢の追撃を振り切り新車のデビュー後初優勝を飾った。
GTEアマクラスはデンプシー・プロトン・レーシングの77号車ポルシェ911 RSR（クリスチャン・リード／ジュリアン・アンドロウアー／マット・キャンベル組）が難レースを制している。日本勢は石川資章のMRレーシング、70号車フェラーリ488 GTEがクラス6位、澤圭太を擁するクリアウォーター・レーシングはクラス7位で“ラストレース”のチェッカーを受けた。
2018／19年WEC“スーパーシーズン”の次戦、第6戦セブリング1000マイルは2019年3月14～16日、アメリカのセブリング・インターナショナル・レースウェイで開催される。
