ウイング効果を持つ新型のアッパーカウルをテストしていたアレイシ・エスパルガロ（アプリリア）が1分29秒501で6番手に続き、ジョナス・フォルガー（ヤマハ・テック3）が1分29秒664で7番手と、2日連続でルーキートップにつけた。
バレンティーノ・ロッシ（モビスター・ヤマハ）はトータル70周を回り、18周目に記録した1分29秒674で8番手に。アレックス・リンス（スズキ）はウイング効果を持たせた新型のアッパーカウルを投入し、1分29秒802で9番手。ジャック・ミラー（マークVDS）が1分29秒838で10番手に続いた。
ダニ・ペドロサ（ホンダ）はノドの不調を訴え、午後2時半を過ぎてから走行を開始。このためトータル40周に止まり、1分30秒245で16番手となった。
■MotoGPフィリップアイランドテスト2日目タイム
天候：晴れ 路面：ドライ
| Pos | Rider | Team | Fastest lap | Laps |
|---|---|---|---|---|
| 1 | マーベリック・ビニャーレス（ヤマハ） | Movistar Yamaha MotoGP | 1'28.847 | 21 / 80 |
| 2 | マルク・マルケス（ホンダ） | Repsol Honda Team | 1'29.309 | 20 / 107 |
| 3 | カル・クラッチロー（ホンダ） | LCR Honda | 1'29.325 | 28 / 80 |
| 4 | アルバロ・バウティスタ（ドゥカティ） | Pull&Bear Aspar Team | 1'29.411 | 42 / 86 |
| 5 | アンドレア・ドビジオーゾ（ドゥカティ） | Ducati Team | 1'29.483 | 32 / 55 |
| 6 | アレイシ・エスパルガロ（アプリリア） | Aprilia Racing Team Gresini | 1'29.501 | 18 / 69 |
| 7 | ジョナス・フォルガー（ヤマハ） | Monster Yamaha Tech 3 | 1'29.664 | 29 / 65 |
| 8 | バレンティーノ・ロッシ（ヤマハ） | Movistar Yamaha MotoGP | 1'29.674 | 18 / 70 |
| 9 | アレックス・リンス（スズキ） | Team SUZUKI ECSTAR | 1'29.802 | 68 / 80 |
| 10 | ジャック・ミラー（ホンダ） | "Team EG 0,0 Marc VDS" | 1'29.838 | 36 / 83 |
| 11 | ヨハン・ザルコ（ヤマハ） | Monster Yamaha Tech 3 | 1'29.880 | 84 / 88 |
| 12 | アンドレア・イアンノーネ（スズキ） | Team SUZUKI ECSTAR | 1'29.947 | 19 / 72 |
| 13 | カレル・アブラハム（ドゥカティ） | Pull&Bear Aspar Team | 1'30.142 | 20 / 73 |
| 14 | ダニロ・ペトルッチ（ドゥカティ） | Octo Pramac Racing | 1'30.150 | 64 / 65 |
| 15 | ホルヘ・ロレンソ（ドゥカティ） | Ducati Team | 1'30.197 | 32 / 64 |
| 16 | ダニ・ペドロサ（ホンダ） | Repsol Honda Team | 1'30.245 | 38 / 40 |
| 17 | エクトル・バルベラ（ドゥカティ） | Avintia Racing | 1'30.352 | 18 / 62 |
| 18 | スコット・レディング（ドゥカティ） | Octo Pramac Racing | 1'30.435 | 83 / 90 |
| 19 | ポル・エスパルガロ（KTM） | Red Bull KTM Factory Racing | 1'30.645 | 24 / 59 |
| 20 | ロリス・バズ（ドゥカティ） | Avintia Racing | 1'30.852 | 34 / 53 |
| 21 | サム・ロウズ（アプリリア） | Aprilia Racing Team Gresini | 1'30.895 | 34 / 64 |
| 22 | ブラドリー・スミス（KTM） | Red Bull KTM Factory Racing | 1'31.704 | 35 / 81 |
