現地時間13時45分から60分間行なわれた予選前最後のセッション、FP3の開始時点では気温は32度、路面温度は37度まで上昇した。
FP2においてコンウェイのドライブ時にイエロー区間での追い越しがあり、トヨタ7号車にはFP3冒頭5分間のストップ＆ホールド（走行禁止）ペナルティが科せられた。
トヨタ8号車は序盤にハートレーが1分43秒557をマーク。ペナルティを消化した7号車はコンウェイがコースインすると1分43秒659を叩き出して8号車に肉薄する。その後、2台とも3名すべてのドライバーがステアリングを握ったが、ベストタイムは更新されなかった。
このFP3では8号車がトップタイムとなったものの、3回のフリープラクティスを通じたベストタイムは7号車（FP2／ロペス）がマークしている。8号車はベストタイム（FP1／ブエミ）で0.6秒の差をつけられおり、ほぼ“サクセス・ハンデキャップ（0.54秒）どおり”の結果となっている。
LMP2では序盤からジャッキー・チェン・DCレーシングの37号車オレカ07・ギブソン（ホー・ピン・タン／ガブリエル・オーブリ／ウィル・スティーブンス）がクラストップを奪う。そこにユナイテッド・オートスポーツの22号車オレカ07・ギブソン（フィル・ハンソン／フェリペ・アルバカーキ／ポール・ディ・レスタ）が肉薄するが、こちらも最後まで順位は変わらず。
LMGTEプロクラスではポルシェGTチーム92号車ポルシェ911 RSR（マイケル・クリステンセン／ケビン・エストーレ）がこのセッションのクラストップとなったが、前日のFP1でアストンマーティン・レーシングの97号車アストンマーティン・バンテージAMR（リチャード・ウェストブルック／マキシム・マルタン）がマークしたタイムを超えることはできなかった。
GTEアマクラスは、このセッションではFP1に続いて98号車アストンマーティン・バンテージAMR（ポール・ダラ・ラナ／ペドロ・ラミー／ロス・ガン）が首位に立ち、FP3を終えている。
ケイ・コッツォリーノの乗り込むLMGTEアマクラスのレッドリバー・スポーツ62号車フェラーリ488GTE Evo（ボナミー・グリムス／コッツォリーノ／コリン・ノーブル）は、いずれもコッツォリーノがチームベストタイムをマークし、FP2でクラス5番手、FP3ではクラス9番手となっている。
予選は現地時間の18時（日本時間24時）より開始される。今回はル・マンで実施された『ハイパーポール』形式ではなく、通常のWEC戦の2ドライバーによる平均タイムによって争われる形へと戻る。2021シーズンは予選方式の変更も検討されているため、現行フォーマットでの最後の予選となる可能性もある。
